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Bio-techne|選好對照,給實驗上道保險

當我們曆經種種挑戰獲得實驗結果,經常會發出疑問三連:

  • 我的實驗結果是不是準确?
  • 我的結果是否出現假陽性或假陰性?
  • 結果的差異是不是因實驗設計中(zhōng)的變量造成的?

要回答(dá)這些問題,合适的對照樣品就成了不可(kě)或缺的一環。

 

一、陰性對照與陽性對照

  • Western Blot 實驗結果有(yǒu)雜帶?
  • IHC 實驗沒有(yǒu)陽性信号?
  • 目的蛋白表達定位與文(wén)獻報道的有(yǒu)出入怎麽辦(bàn)?

要回答(dá)這些問題,就需要在實驗中(zhōng)設置陰性或陽性對照。

陽性對照品一般會使用(yòng)文(wén)獻或數據庫中(zhōng)報道的高表達目的蛋白的組織或細胞。陽性對照确保了實驗的靈敏度,也保證了實驗過程中(zhōng)抗原抗體(tǐ)的結合效率。

陰性對照品一般會使用(yòng)或文(wén)獻或數據庫中(zhōng)報道的低表達目的蛋白的組織或細胞,使用(yòng)敲低或敲除目的基因的樣本。在 IHC/ICC 實驗中(zhōng),也可(kě)以用(yòng) PBS 或同型對照代替一抗。陰性對照确保了實驗的特異性,排除非特異性信号對結果造成的幹擾。

 

接下來,我們舉個例子:

比如用(yòng)二乙基亞硝胺誘導小(xiǎo)鼠肝纖維化,常常用(yòng) Alpha-SMA 作(zuò)為(wèi)肝纖維化的标志(zhì)物(wù)。在進行 IHC 實驗時,為(wèi)了保證陽性信号的可(kě)靠性,就需要平行加一個胃或結腸組織的樣本作(zuò)為(wèi)對照。因為(wèi),Alpha-SMA 會特異性的表達在平滑肌細胞,而黏膜細胞無表達。

圖片來源:W Li et al. Cell Death Dis (2019).

如上圖的所示,胃平滑肌層陽性信号明顯,黏膜層無陽性信号,證明抗體(tǐ)得到的信号是敏感且特異的(Alpha-SMA,貨号 NBP2-33006)。

 

二、同型對照

這個概念,相信深谙流式細胞技(jì )術的小(xiǎo)夥伴都耳熟能(néng)詳。因為(wèi)抗體(tǐ)本身的特殊功能(néng),特别是抗體(tǐ) IgG Fc 段與細胞的 Fc 受體(tǐ)結合的能(néng)力,會使實驗結果的非特異性信号加強。

同時,在一些抗體(tǐ)的功能(néng)性實驗,比如中(zhōng)和實驗和封閉實驗中(zhōng),也會對細胞(尤其是免疫細胞)的生理(lǐ)功能(néng)産(chǎn)生一定的影響,進而導緻實驗結果與預期或文(wén)獻報道不相符。

抗體(tǐ)結構與抗體(tǐ)類型示意圖

這時,同型對照就是必不可(kě)少的工(gōng)具(jù):

同型對照是陰性對照的一種,是利用(yòng)與實驗抗體(tǐ)同亞型的免疫球蛋白,排除實驗本底信号的工(gōng)具(jù)。廣泛運用(yòng)在免疫組化、免疫熒光、流式細胞術、抗體(tǐ)封閉中(zhōng)和實驗等一些以抗原-抗體(tǐ)結合為(wèi)基礎的實驗中(zhōng)。

同型對照需要選用(yòng)與目标抗體(tǐ)相同種屬來源、相同的免疫球蛋白類型及亞型的抗體(tǐ)。如果是應用(yòng)在流式細胞術,還需要标記相同的熒光素。我們通常建議選用(yòng)來自與特異熒光抗體(tǐ)相同生産(chǎn)廠家的同型對照抗體(tǐ), 因為(wèi)其生産(chǎn)工(gōng)藝、熒光蛋白比值以及标記工(gōng)藝都是相同的。

比如:

用(yòng)  Mouse Anti-Human MICA PE-conjugated Monoclonal Antibody(貨号 FAB1300P)檢測 K562  細胞表面的 MICA,因為(wèi)該抗體(tǐ)的種屬來源是小(xiǎo)鼠,免疫球蛋白是 IgG,亞型是 2B,标記的熒光素是 PE,所以,我們使用(yòng)的同型對照應該是 Mouse IgG2B PE 抗體(tǐ)(貨号 IC0041P)。

如上圖,左邊藍色的峰為(wèi)同型對照,右邊橙色的峰為(wèi) MICA 特異性的 PE 信号峰。有(yǒu)了同型對照,自然就能(néng)分(fēn)辨出合适的陽性熒光強度,為(wèi)之後設門和進一步分(fēn)析打下可(kě)靠的基礎。

設置合适的對照就像給實驗加上一層保險,保證了實驗結果的可(kě)靠性,也為(wèi)後續實驗的優化及 trouble shooting 提供了重要的線(xiàn)索。

 

以上文(wén)字和圖片來源于Bio-techne

 

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