近日，北京的新(xīn)發地出現多(duō)個新(xīn)冠肺炎本土确診病例，讓逐漸平靜的國(guó)内疫情形勢再度緊張起來。

迄今為(wèi)止尚未找到對抗 SARS-CoV-2 的特效辦(bàn)法，藥物(wù)及疫苗的研發正在緊張的開展中(zhōng)，全面解析 SARS-CoV-2，解開蛋白密碼，是研發的重要前提。本文(wén)，我們大起底 SARS-CoV-2 編碼蛋白與 SARS-CoV 蛋白的同源性、分(fēn)類及功能(néng)。

非結構蛋白與結構蛋白

SARS-CoV-2 是一種約 30kb 的陽性單鏈 RNA 病毒，其基因組組成與 SARS-CoV 相似，兩者都是由兩個主要的開放閱讀框（ORF）和幾個較小(xiǎo)的下遊 ORF 組成。

兩個主要的 ORF（ORF1a 和 ORF1b）編碼兩個多(duō)肽，被病毒編碼的蛋白酶切割後産(chǎn)生非結構蛋白（nsps）。ORF1a 編碼 440-500 kDa 多(duō)肽（pp1a），該多(duō)肽經過酶處理(lǐ)裂解成 11 個  nsps。ORF1b 編碼 740-810 kDa 的較大多(duō)肽（pp1ab），該多(duō)肽被切割為(wèi) 16 個 nsps。

在 SARS-CoV-2 中(zhōng)已鑒定出四種主要的結構蛋白，包括刺突蛋白、核衣殼蛋白、膜蛋白和包膜蛋白，與 SARS-CoV 具(jù)有(yǒu)顯著的同源性。這四個結構蛋白由 ORF2-10 編碼，是病毒形成外殼和基因組衣殼化所必需的。與非結構蛋白相比，結構蛋白能(néng)引發更高水平的體(tǐ)液免疫和細胞免疫反應。

結構蛋白之刺突蛋白

SARS-CoV-2 的刺突蛋白是病毒表面的糖蛋白，由兩個主要功能(néng)結構域 S1（14-667 aa）和 S2（668-1255 aa）組成，分(fēn)别介導與宿主細胞受體(tǐ)結合和膜融合。病毒的附着和進入宿主細胞取決于刺突蛋白的受體(tǐ)結合域（RBD：306-527aa）與特定細胞蛋白的相互作(zuò)用(yòng)。

研究表明，血管緊張素轉化酶 2（ACE-2）和蛋白酶 TMPRSS2 分(fēn)别是 SARS-CoV-2 進入宿主細胞所需的細胞受體(tǐ)和蛋白酶。靶向 ACE-2 的抗體(tǐ)（中(zhōng)和抗體(tǐ) AF933，21 Citations），有(yǒu)望成為(wèi)治療新(xīn)冠肺炎的有(yǒu)效方法之一。

蛋白酶 TMPRSS2 和/或 cathepsin L 在 S1-S2 連接處切割刺突蛋白，從而使病毒包膜與細胞膜融合，促使病毒 RNA 進入細胞。SARS-CoV-2 也可(kě)以被 furin 蛋白酶切割，其識别 S1-S2 連接處的四個氨基酸序列。除了在 S1-S2 連接處切割刺突蛋白外，細胞蛋白酶還可(kě)以剪切 S2 亞基，這對于刺突蛋白的激活和随後的膜融合至關重要。

✦ SARS-CoV-2 與 SARS-CoV 的刺突蛋白序列比較如何？

SARS-CoV-2 的表面糖蛋白或刺突蛋白與 SARS-CoV 的刺突蛋白具(jù)有(yǒu) 76% 的序列同源性。Novus Biologicals® 提供了幾種用(yòng)于檢測 SARS-CoV 刺突蛋白的抗體(tǐ)，這些抗體(tǐ)可(kě)用(yòng)于 WB、ICC / IF、ELISA 等多(duō)種應用(yòng)。根據Novus 的創新(xīn)計劃，不妨試驗其中(zhōng)的抗體(tǐ)用(yòng)于檢測 SARS-CoV-2。

用(yòng)于檢測 SARS-CoV 的刺突蛋白抗體(tǐ)：

結構蛋白之核衣殼蛋白

核衣殼蛋白（419 aa）位于 SARS-CoV-2 病毒顆粒的核心，并與病毒 RNA 相互作(zuò)用(yòng)。在病毒組裝(zhuāng)過程中(zhōng)，核衣殼蛋白在包裝(zhuāng)病毒 RNA 基因組中(zhōng)發揮着核心作(zuò)用(yòng)。SARS-CoV 核衣殼蛋白還參與其他(tā)功能(néng)，例如調節宿主的細胞過程，包括細胞周期失調、抑制 IFN 産(chǎn)生和誘導促炎因子（例如 COX-2）産(chǎn)生等。

✦ SARS-CoV-2 與 SARS-CoV 之間的核衣殼蛋白序列比較如何？

SARS-CoV-2 與 SARS-CoV 的核衣殼蛋白具(jù)有(yǒu) 91% 的序列同源性。Novus Biologicals® 提供了幾種用(yòng)于檢測 SARS-CoV 核衣殼蛋白的抗體(tǐ)，這些抗體(tǐ)可(kě)用(yòng)于 WB、ICC / IF、ELISA 等多(duō)種應用(yòng)。

用(yòng)于檢測 SARS-CoV 核衣殼蛋白的抗體(tǐ)：

最近美國(guó)國(guó)立衛生研究院的一項研究成功建立了 SARS-CoV-2 感染的恒河猴動物(wù)模型，并利用(yòng)兔多(duō)克隆抗 SARS-CoV 核衣殼抗體(tǐ)（貨号 NB100-56576）成功檢測了 SARS-CoV-2 病毒在感染組織中(zhōng)的存在。

感染 SARS-CoV-2 的恒河猴的病理(lǐ)變化。通過免疫組化檢測以下細胞/組織中(zhōng)的 SARS-CoV-2 核衣殼抗原：（g）Ⅰ 型肺泡細胞；（j）Ⅰ 型肺泡細胞，Ⅱ 型肺泡細胞及肺泡巨噬細胞；（k）縱隔淋巴結和（l）盲腸固有(yǒu)層中(zhōng)的巨噬細胞和淋巴細胞。圖片由 bioRxiv March 21, 2020// doi. org/ 10. 1101/ 2020. 03. 21. 001628  一文(wén) Figure 4 修改。

最新(xīn) SARS-CoV-2 重組刺突蛋白及核衣殼蛋白：

結構蛋白之膜蛋白和包膜蛋白

膜蛋白（222 aa）和包膜蛋白（75 aa）是在病毒包裝(zhuāng)中(zhōng)發揮作(zuò)用(yòng)的整合蛋白。衆所周知，SARS-CoV 的膜蛋白能(néng)使 SARS 患者産(chǎn)生中(zhōng)和抗體(tǐ)，而包膜蛋白介導 SARS-CoV 的毒力，并扮演離子通道的角色。

✦ SARS-CoV-2 與 SARS-CoV 的膜蛋白和包膜蛋白序列比較如何？

SARS-CoV-2 與 SARS-CoV 的膜蛋白具(jù)有(yǒu) 91% 的序列同源性，包膜蛋白具(jù)有(yǒu) 95% 的序列同源性。Novus Biologicals® 提供了幾種用(yòng)于檢測 SARS-CoV 内膜蛋白和包膜蛋白的抗體(tǐ)，這些抗體(tǐ)可(kě)用(yòng)于 WB、ICC / IF、ELISA 等多(duō)種應用(yòng)。

用(yòng)于檢測 SARS-CoV 的内膜蛋白和包膜蛋白抗體(tǐ)：

非結構蛋白大揭秘

非結構蛋白（nsps）在病毒複制周期中(zhōng)發揮不同的功能(néng)，編碼的 nsps（1-16）共同形成蛋白複制酶-轉錄酶複合物(wù)。

✦ SARS-CoV nsp5 和 nsp13 蛋白的抗體(tǐ)

SARS-CoV-2 與 SARS-CoV 的 nsp5 具(jù)有(yǒu) 96% 序列同源性，nsp13 具(jù)有(yǒu) 99% 的序列同一性。Novus Biologicals® 提供了針對 nsp5（NBP1-78110）和 nsp13（nbp2-89168）蛋白的兔多(duō)克隆抗體(tǐ)，這些抗體(tǐ)可(kě)用(yòng)于 WB、ICC / IF、ELISA 等多(duō)種應用(yòng)。

感染 6 小(xiǎo)時後的 Vero-E6 細胞中(zhōng)，使用(yòng)抗 SARS-CoV nsp13 兔多(duō)克隆抗體(tǐ)（NBP2-89168）進行免疫熒光顯微鏡檢查。