楊劍課題組是目前中(zhōng)國(guó)醫(yī)學(xué)科(kē)學(xué)院病原生物(wù)學(xué)研究所唯一專門從事生物(wù)信息學(xué)相關研究的團隊。課題組包括由研究員、副研究員、助理(lǐ)研究員和博士後等多(duō)人組成的核心科(kē)研團隊，專業涉及醫(yī)學(xué)、生物(wù)學(xué)、物(wù)理(lǐ)學(xué)、計算科(kē)學(xué)和生物(wù)醫(yī)學(xué)工(gōng)程等多(duō)學(xué)科(kē)背景，注重學(xué)科(kē)交叉融合特色發展。近年來，課題組兼顧病原生物(wù)學(xué)基礎研究和傳染病防控重點需求。一方面，課題組通過大數據整合與挖掘、設計通用(yòng)分(fēn)類方案、開發在線(xiàn)識别系統和卷積神經網絡模型等，成功建立國(guó)際上最大的病原細菌毒力因子數據平台VFDB，并先後揭示了細胞外可(kě)伸縮注射系統和毒素複合體(tǐ)等多(duō)種毒力因子的遺傳多(duō)樣性和結核分(fēn)枝杆菌的耐藥性特征，通過生物(wù)信息學(xué)探索推動了相關病原菌的緻病和耐藥機制研究；另外一方面，課題組面向新(xīn)發傳染病防控重大需求，在國(guó)際上最早探索基于宏基因組的病原體(tǐ)高通量篩查數據挖掘新(xīn)方法，并建立了全球首個重要疫源生物(wù)相關病毒數據平台ZOVER，參與近年來的多(duō)次重大疫情相關病原體(tǐ)鑒定和數據分(fēn)析，為(wèi)我國(guó)新(xīn)發傳染病疫情防控能(néng)力提升貢獻了力量。課題組近五年培養博士研究生5名(míng)，均按期畢業，其中(zhōng)1人次獲得國(guó)家獎學(xué)金、1人次入選北京市優秀畢業生、3人次入選北京協和醫(yī)學(xué)院優秀畢業生。